האגף פועל מאז 1.2.2005 כאגף ייחודי כנותן שירות למשפחות השכולות : הורים שכולים, אלמנות ויתומים. עד להקמתו ניתן השירות במסגרת אגף השיקום.
אגף משפחות והנצחה הינו גוף ממלכתי המבטא כבוד, הוקרה ומחויבות לנופלים
ולבני משפחותיהם. עובדי האגף פועלים למתן שירות מקצועי , רגיש , ייחודי ומופתי לשיקום ולרווחת המשפחות השכולות.
אגף משפחות והנצחה פועל מכוח שני חוקים עיקריים:
חוק משפחות חיילים שנספו במערכה (תגמולים ושיקום) תש"י - 1950
חוק בתי קברות צבאיים, תש"י - 1950
יחידת ההנצחה פועלת בכל הקשור לקבורה הצבאית .במקביל , נבחנת הזכאות של בני המשפחה השכולה לקבלת זכויות לפי חוק משפחות חיילים שנספו במערכה.
משפחה המוכרת על ידי קצין התגמולים לקבלת זכויות מופנית למחוזות המטפלים.
האגף פועל בפריסה ארצית של מחוזות הנותנים שירות. לאגף שישה מחוזות הנותנים שירותי טיפול ומימוש זכאויות וארבעה מחוזות של שירותי הנצחה.
השירות ניתן על ידי עובדים סוציאליים , עובדי רווחה ועובדי יחידת הנצחה.
הסיוע המוענק למשפחות כולל טיפול רגשי בהתמודדות עם האובדן , תגמולים חודשיים ,הטבות בנושאים שונים והנצחת זכר הנופלים.